משמעותו של סמל בית הספר "יגאל אלון" באה לידי ביטוי בצורתו החיצונית "בועת החשיבה והדיבור", בצורת החלקים המרכיבים אותו "הפאזל" ובצבעי חלקי הפאזל, המבוססים על "ששת כובעי החשיבה" של אדוארד דה בונו.
בועת החשיבה והדיבור מייצגת את השאיפה לתרבות של דיאלוג, המייצר תקשורת בונה ומגינה.
חלקי הפאזל המרכיבים את בועת החשיבה והדיבור מסמלים את כולנו, הפרטים המרכיבים את קהילת בית הספר. שונים אחד מהשני, עצמאיים, יחידים ומיוחדים אך יוצרים יחד שלם הגדול מסך חלקיו.
ששת צבעי הסמל הם בהשראת "כובעי החשיבה" של אדוארד דה בונו, אשר פיתח שיטת חשיבה שמטרתה שיפור תהליך הדיאלוג וקבלת ההחלטות בקבוצות, תוך הרחבת יכולת החשיבה על נושא מהיבטים שונים.
הצבע הלבן – מסמל איסוף מידע וחשיבה ניטראלית
הצבע האדום – מסמל חשיבה רגשית, המחוברת לתחושות, רגשות ואינטואיציה.
הצבע השחור – מסמל חשיבה ביקורתית המציפה בעיות וחסרונות.
הצבע הצהוב – מסמל חשיבה חיובית המציגה יתרונות ותועלת.
הצבע הירוק – מסמל יצירתיות, המחפשת רעיונות ופתרונות חדשים.
הצבע הכחול – מסמל את ניהול החשיבה במבט על ובדיקת תהליך החשיבה עצמו.